值得注意的是，有些人用一把牙刷的時間很長，甚至長達幾年也不更換，這對口腔健康是極為不利的。一是使用牙刷的時間較長時，牙刷的毛束變形開叉，容易損傷牙齦；二是使用時間較長，會造成細菌在牙刷上繁殖。牙科醫生曾對使用過的牙刷進行細菌培養。結果表明，新牙刷使用一個月，就有大量細菌生長繁殖其上。其中有許多致病菌，如白色念珠菌、溶血性鏈球菌等。如果用這種帶菌的牙刷刷牙，不僅容易因刷傷牙齦而造成牙周炎症，還可能讓這些細菌通過口腔直接侵入人體消化道和呼吸道，引起腸炎和肺部感染等症。還可以通過口腔粘膜破損處進入人體血液，引起敗血症及組織膿腫等全身性的炎症。所以，牙刷使用時間不宜過長。通常每季度更換一把或發現刷毛彎曲時及時更換，否則不但起不到清潔保健作用，反而會造成牙齦損傷。平時也可準備兩把牙刷交替使用。
據觀察，有一些患牙齦炎或咽喉疾病的人，久治不愈，換了一支牙刷後，竟奇跡般的好了。採用經常更換新牙刷的辦法，有些病人的牙齦長期不再感染。還有的人好得感冒，而且易反復發作，三天兩頭一有風吹草動，就會感冒。這裏重點提醒，感冒後最好換把牙刷，因為牙刷中會藏有大量病菌，這是引起反復感冒的病因之一。另外要特別注意的是一定要各用各的牙刷，牙刷絕對不可以和別人混用。和朋友等人混用牙刷刷牙，極容易感染各種口腔及全身性疾病。
牙刷的保管方法也很重要。牙刷使用後要徹底洗滌，儘量甩掉刷毛上的水份，因為潮濕的刷毛容易滋生細菌，甩幹水份後將刷頭向上放入漱口杯中，置乾燥通風處，不宜放在密閉的牙刷盒中。
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