不同的错颌畸形矫治的最佳年龄有所不同。在乳牙期（3~5岁）和替牙期（6〜11岁），一般的错颌畸形如个别牙齿错位，不需要立即矫正，应当继续观察和纠正口腔不良习惯，因为在这个时期，牙齿正处于调整时期，随着不良习惯的纠正，错颌畸形常可以部分自行矫正。这时的生长发育速度很快，不适当的矫正会影响发育。
但是对于严重影响发育的错颌畸形，则需要进行初步的矫治。如乳牙反颌，会妨碍上颌骨的发育，影响面部的外形，应当及时矫治。如孩子能配合。在3~5岁都可矫治。又如严重下颌后缩，在替牙期就可进行矫治，以阻断其向严重发展，也可为以后继续矫治减小难度。上前牙的中度扭转，也可在替牙期间矫治。大多数的错颌畸形要等到牙齿替换后，在恒牙期（12〜14岁）才进行矫治。因为这时恒牙牙根的发育已完成，上、下牙齿间的咬合关系也调整完成，可以对错給畸形的类型作出明确的诊断，并采取相应的矫治方法。矫治完成后也容易保持稳定的效果，不会再有大的变化。从理论上讲，儿童矫治错颌畸形的最佳年龄是在儿童的生长发育高峰期。男孩在12-14岁，女孩在11-13岁，但是各个儿童的生长发育又有个体差异，不得一概而论。正确的方法是通过一定的检测手段来估计生长发育的高峰期。例如拍摄手腕骨X线片，连续测量身高，了解女性的月经初潮等。在这个时期进行矫治，疗程短，效果好。如果错过这个时期，如到15-17岁，仍处于青少年期，生长发育仍然比较活跃，虽然难度略有增加，但矫治效果也比较好。如果到了18岁以后，进入成年期，生长发育基本完成，矫正效果就不如儿童期和青少年期。但是对于严重的骨性错颌畸形，不能单纯用正畸的方法来完成矫治，必须等到18岁以后，配合正颌外科手术来进行治疗。
