植牙手術要求必須要喺無菌嘅手術室中完成，咁可大大減少感染機會，使植牙成功率更高。口腔植牙中心手術室應寬敞明亮、設計規範、消毒嚴格。按照國際標准，種植牙手術室面積唔可以小於12平方米，另外要配有專門嘅手術准備室、洗手池、紫外線消毒燈、空氣過濾機等。  

手術室中間擺放一張電子控制嘅牙科手術椅，植牙設備、用具擺放有序，紫外線空氣消毒燈懸掛其中。手術室除牙科治療椅，還應具有便於術者及助手進行操作、擺放手術時需要使用嘅各種器械和平時存放相關器械設備嘅空間。消毒制度嚴格按國家有關規定執行，力求做到消毒萬無一失，徹底杜絕交叉感染。

手術光源既可以直接利用牙科椅上自帶嘅燈光，亦可以單獨配備手術燈。如利用牙科椅上自帶嘅光源，光源手柄需要消毒並罩上幹凈嘅隔離巾。而手術燈嘅照明範圍較寬，無影效果相對較好，手柄還可滅菌處理。